11月6日上午，台湾当局领导人马英九在台北宾馆会见了海协会会长陈云林及协商代表团主要成员、海基会董事长江丙坤等海基会人员。马英九在致辞中说，两会此次协商签署了空运直航、海运直航、邮政合作和食品安全四项协议，并且深入地讨论了两岸金融合作的议题，对于便利两岸人民的往来，促进双方经贸的交流，强化食品卫生的安全，抵御国际金融风暴，都有积极而正面的作用，成果非常丰硕。马英九赠给陈云林的礼品是台湾少数民族达悟人独木舟造型的著名莺歌陶作，象征“两岸三通、春暖花开、前景光明”。陈云林回赠给马英九的是著名画家韩美林的画作《骏马图》。