2004年5月17日，经国务院批准，中国证监会正式发出批复，同意深交所在主板块市场内设立中小企业板块，并核准了中小企业板块实施方案。

2004年5月19日，公布《中小企业板块交易特别规定》、《中小企业板块上市公司特别规定》和《中小企业板块证券上市协议》。

2004年5月27日，举行中小企业板块启动仪式。

2004年6月25日，举行中小企业板块首次上市仪式，新和成等8家公司挂牌上市。

2004年7月11日，深交所贯彻“从严监管”的原则，就信息披露中的违规行为对江苏琼花高科技股份有限公司及相关人员予以公开谴责。

2004年8月10日，深交所发布《中小企业板块保荐工作指引》。

2004年12月30日，发布《深圳证券交易所中小企业板块上市公司诚信建设指引》。

2005年3月1日，深交所发布《中小企业板块上市公司董事行为指引》。

2005年6月20日，10家中小板公司进入第二批股改试点，中小板股改工作正式启动。2005年11月21日，中小板最后一家公司黔源电力股改方案获得通过。中小板50家公司率先全面完成股改。

2005年12月1日，深交所开始发布中小企业板指数，指数基日定为2005年6月7日，基日指数为1000点。

2006年1月12日，深交所发布《中小企业板投资者权益保护指引》。

2006年5月22日，由华夏基金与深圳证券交易所、中国建设银行联合推出的中小板股票基金（ETF）开始正式发行。

2006年6月19日，中工国际作为IPO重启的首只新股在中小企业板挂牌，因股价波动剧烈，其后深交所在中小企业板试行以换手率、盘中波幅为指标的风险提示和临时停牌的风险控制机制。

2006年7月13日，深交所发布《中小企业板上市公司募集资金管理细则》。

2006年11月30日，深交所正式发布了《中小企业板股票暂停上市、终止上市特别规定》，并于2007年1月1日开始执行。

2006年12月1日，天康生物、海翔药业刊登招股意向书后，中小企业板上市及发行企业家数达到百家。

2006年12月4日，浙江网盛科技登陆中小企业板，国内Ａ股迎来首家纯互联网概念上市公司。

2007年4月24日，中小企业板日成交额首次突破100亿元。

2007年5月18日，深交所发布《中小企业板上市公司控股股东、实际控制人行为指引》。

2007年7月23日，深交所发布《关于在中小企业板实行临时报告实时披露制度的通知》，从2007年8月6日起中小板上市公司临时报告增加午间披露时段。

2007年8月10日，深交所发布《关于进一步加强中小企业板股票上市首日交易监控和风险控制的通知》。

2007年11月19日，深交所决定对中小板系列指数进行完善，将中小板100指数（代码：399329，简称：中小板指）作为中小板市场的主要指数。

2008年1月21日，发布《深圳市场首次公开发行股票网下发行电子化实施细则》。

2008年2月4日，发布《中小企业板上市公司募集资金管理细则（2008年修订）》，同时发布《中小企业板上市公司临时报告内容与格式指引第9号：募集资金年度使用情况的专项报告》。

2008年2月8日，发布《中小企业板上市公司保荐工作评价办法》

2008年4月11日，首家通过深交所网下发行电子平台以及中国结算深圳分公司登记结算平台进行网下发行的江苏鱼跃医疗设备股份有限公司网下发行工作结束，标志着深市首发新股网下发行电子化的成功实施。

2008年4月28日，深交所和中国结算深圳分公司共同发布《关于进一步规范中小企业板上市公司董事、监事和高级管理人员买卖本公司股票行为的通知》。

2008年12月8日，修订了《中小板保荐工作指引》。