清算机构是为金融机构提供资金清算服务的中介组织，在各国的支付清算体系中占有重要位置。清算机构在不同国家有不同的组织形式，一般有票据交换所、清算中心、清算协会等类型。如为金融机构提供票据交换与清算服务的票据交换所，是最传统、最典型的清算机构，随着现代科技在金融领域的应用，在很多国家和地区，票据交换所已经广泛地实现了票据交换的电子化和自动化。
另外，不同国家的清算机构在经营者、业务范围等方面也有所不同：
既有私营的，也有政府或货币当局组建的；既有地方性的，也有全国范围的；既有只提供国内清算服务的，也有提供国际性清算服务的协会组织，等等。
清算机构一般实行会员制度，会员必须遵守组织章程和操作规则，并需交纳会员费。在很多国家，中央银行通常作为清算机构的主要成员，直接参与清算支付活动；而在另一些国家，中央银行不直接加入清算机构组织，但对其实行监督、审计，并为金融机构提供清算服务。各国的主要清算机构通常拥有并经营支付系统，通过支付系统的运行实现清算。